Het hoofdorgel van de Dorpskerk werd gebouwd door Jacobus Zeemans uit Breda en werd op 3 november 1720 in gebruik genomen (het jaartal 1635 boven de orgelkas heeft te maken met bouwwerkzaamheden aan de kerk). Het bezat oorspronkelijk anderhalf klavier en telde 1294 pijpen.
Tussen 1720 en 1839 werkten achtereenvolgens R. Garrels, P. Assendelft, Joh. Mitterreither, J. Reichner en C. Hagedoorn aan het instrument. In 1839 heeft de firma Lohman een ingrijpende restauratie uitgevoerd. Bas- en diskantverdeling verdween en de omvang van het positief onder in de kas werd even groot als het hoofdwerk. Het pedaal bleef aangehangen.
De orgelkas werd in 1913 door de firma Bik uit Leiden aan weerskanten uitgebreid. In 1952 is het instrument door W. van Leeuwen uit Leiderdorp opnieuw gerestaureerd.
In 2002 heeft een herintonatie plaatsgevonden door G. van Buuren uit Heukelum. Getracht is aansluiting te vinden bij het oorspronkelijke klankbeeld van het instrument. Het instrument heeft thans meer dan 1300 pijpen.

Boven de orgelkas prijken twee wapenschilden. De linker behoort toe aan Arent Baron van Wassenaar, Heer van Duivenvoorde, die naar alle waarschijnlijkheid in 1720 het startschot voor de orgelbouw gaf. Het rechter behoort toe aan zijn vrouw, Anna Margarethe Bentinck.
De tegenwoordige gemeentewapens van Wassenaar en Voorschoten zijn ontleend aan deze schilden.
Ten behoeve van de kerkmuziek is aan de dorpskerk een cantorij verbonden. Landelijk bezien valt onze kerk in de één na hoogste muziekcategorie.

Hoofdwerk ( Groot orgel )
Prestant 8’ Roerfluit 8’
Octaaf 4’ Fluit 4’
Nasard 2 2/3’ Octaaf 2’
Mixtuur 3 tot 4 st. Trompet 8’
Sesquialter 2 st.

Positief ( Klein orgel )
Holpijp 8’ Prestant 4’
Roerfluit 4’ Woudfluit 2’
Quint 1 1/3’ Scherp 2 tot 3 st.
Dulciaan 8’

Pedaal ( Voetklavier )
Subbas 16’ Prestant 8’

Koppels
Koppel Positief aan Hoofdwerk
Koppel Positief aan Pedaal
Koppel Hoofdwerk aan Pedaal
Tremulant op Positief

De kerk is in 1993 verrijkt met een koororgel van drie stemmen : Gedekt 8’, Roerfluit 4’ en Presant 2’. Het is 40 jaar geleden gebouwd door de firma J. de Koff in Utrecht.

Lijst van organisten: